iPhone 16e, podobnie jak wycofany iPhone SE, nie obsługuje MagSafe. Oznacza to, że akcesoria takie jak etui, ładowarki, powerbanki i portfele MagSafe nie będą kompatybilne z tym modelem. Mimo to urządzenie nadal wspiera standardowe ładowanie bezprzewodowe Qi do 7,5 W. To pierwszy iPhone z nowoczesnym designem bez MagSafe, który Apple wprowadziło w 2020 roku wraz z serią iPhone 12. Apple zaprezentowało iPhone’a 16e